在这三个机构所称的同类最大的学术合作中，麻省理工学院和哈佛大学、达纳法伯癌症研究所和圣裘德儿童研究医院宣布了一项为期五年、耗资 6000 万美元的项目，以解决与癌症相关的关键知识差距。小儿癌症的生物学基础，以及如何更有效地治疗它。

该项目的联合资金称为儿科癌症依赖性加速器，将支持基础设施的发展以及 80 多名研究人员、数据科学家和相关研究人员的工作——每个机构增加的人数预计将超过 100 名团队成员工作人员支持工作。

跨职能小组将专注于三个核心疾病领域——脑肿瘤、血液系统恶性肿瘤和实体瘤——并将结合数据科学、功能基因组学和大规模药物筛选方面的泛癌专业知识。

该项目由圣裘德综合癌症中心主任、医学博士、医学博士 Charles WM Roberts 共同领导； Kimberly Stegmaier，医学博士，丹娜—法伯癌症研究所，儿科肿瘤研究副主席；和弗朗西斯卡巴斯克斯博士，广泛研究所癌症依赖地图项目主任。

“尽管取得了许多进展，但癌症仍然是美国儿童因疾病而死亡的第一大原因，”罗伯茨在一份新闻稿中说。 “研究实验室可能需要数十年的时间才能了解机制并开发新的治疗方法。通过这个项目，我们相信我们现在可以跨越障碍，快速识别儿童癌症的治疗漏洞，并更快地将其转化为临床的靶向治疗。”

儿科癌症依赖性加速器的重点研究旨在开发针对侵袭性儿科癌症的新疗法，包括：

开发和部署基因组编辑技术，以识别一系列高危儿童脑癌、实体癌和血癌中隐藏的脆弱性（依赖性）；

利用新兴技术来表征儿科癌症的遗传和表观遗传情况；

开发目前尚不存在的模型系统，用于治疗结果不佳的高危儿童癌症；

确定有效的联合疗法和耐药机制，缩短开发新疗法的时间；开发

计算方法来挖掘和整合数据，开发创新的数据共享软件工具。

为实现其目标，加速器将结合三个机构中的每一个，建立开放多年的开创性研究。

例如，圣犹达华盛顿大学儿科癌症基因组计划是一项 6500 万美元的合作项目，该项目于 2010 年开始，旨在对 600 名儿童癌症患者的完整正常和癌症基因组进行测序——当时大多数癌症研究都集中在成人受试者身上。完成后，该项目拥有 800 名儿童的完整正常和癌症基因组，还包括另外 1200 名患者的全外显子组和全转录组测序，其中包括 23 种不同的癌症。

但是，开发针对儿科癌症的新的、有针对性的治疗方法需要的不仅仅是基因组数据。 Broad 的计算专业知识对该项目至关重要。其癌症依赖图 (DepMap) 计划开发了广泛的数据集和计算基础设施，这些基础设施影响了全球的研究和目标发现计划。儿科癌症依赖性地图项目 (PedDep) 于 2015 年启动，作为将 DepMap 方法应用于儿童癌症的概念验证。

Broad 的两个项目的成功之一是成功部署了全基因组 CRISPR 筛选工具，这些工具已被用于发现成人癌症的脆弱性。这些也已被证明是询问儿童癌症易感性的有效手段，这些癌症通常具有更简单的基因组。这些工作还产生了大规模药物筛选能力的发展。

“PedDep 加速器体现了深度合作的力量，以及将跨机构的多学科团队聚集在一起以应对影响全球儿童的重要疾病挑战，”Vazquez 说。 “通过数据共享和工具开发，我们致力于创造一种资源，科学界可以利用这些资源对儿童癌症产生真正的影响。”

St. Jude 和 Dana-Farber 将提供创建患者衍生异种移植 (PDX) 模型的专业知识，该模型使用来自患者的癌细胞，从而更紧密地匹配临床中出现的疾病生物学。 St. Jude 的计算生物学家将有助于分析表观基因组和基因组特征、数据可视化和计算管道的开发。

“我们的第一代儿科癌症依赖性地图项目非常成功，但只是冰山一角，”Stegmaier 说。 “PedDep 加速器将发现新的、急需的新治疗靶点，同时揭示各种儿童癌症的机制基础，为我们的研究界提供数据宝库。”